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PCR儀的選購

PCR的原理:

    DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶的作用下,以單鏈為模版,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則復(fù)制成新的單鏈,與模版配對成為雙鏈分子挎貝。在體外實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,并設(shè)計(jì)與模板DNA的5’端結(jié)合的兩條引物,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制,多次重復(fù)“變性解鏈—退火—合成延伸”的循環(huán)就可以以幾何級數(shù)大量擴(kuò)增特定的基因。

   從PCR原理可以看出,PCR儀的關(guān)鍵是升降溫的步驟?,F(xiàn)在偶爾還能聽到一些前輩們笑談早年的PCR實(shí)驗(yàn)如何在3個水浴鍋中完成的趣聞。經(jīng)過不斷改進(jìn),今天的PCR已經(jīng)越來越完善和智能化。出于市場推廣的戰(zhàn)略需要,各廠家的PCR儀型號不同,著力宣傳的技術(shù)指標(biāo)和參數(shù)也不盡統(tǒng)一,天呈在這里簡單列出選購時(shí)我們認(rèn)為應(yīng)該考慮的常用指標(biāo),希望有助于大家選購PCR儀的選購技巧。

PCR儀的種類:

    PCR儀的種類總體來說可以分為兩大類:PCR擴(kuò)增儀和實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,普通的PCR擴(kuò)增儀又衍生出帶梯度PCR功能的梯度PCR儀、和帶原位擴(kuò)增功能的原位PCR儀等等。

    PCR重要的就是個升降溫過程,初的水浴鍋式PCR,就是三個水浴箱,一個機(jī)械臂,定時(shí)抓出反應(yīng)槽轉(zhuǎn)換水浴鍋。這種儀器體積大,迅速慢,但其實(shí)結(jié)果并不比以后的PCR儀差。后來有人利用致冷和加熱做成了,固定位置升降溫的PCR擴(kuò)增儀。

    后來隨著定量技術(shù)的發(fā)展,有公司將擴(kuò)增儀和檢測做成一體,也就成了現(xiàn)在的實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。1996年由ABI公司首先推出將擴(kuò)增和檢測融為一體的實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

PCR儀的選購:

一、溫度控制
    對普通PCR儀來說,溫度控制主要是介質(zhì)問題,理想的介質(zhì)是導(dǎo)熱性好、比熱大、接觸緊密的物質(zhì)。溫控指標(biāo)主要是指溫度的準(zhǔn)確性、均勻性、以及升降溫速度,對梯度PCR儀來說,除了溫度的準(zhǔn)確性和均勻性、升降溫速度以外,還必須考慮儀器在梯度模式和標(biāo)準(zhǔn)模式下是否具有同樣的溫度特性。關(guān)于溫度控制方面,作者將在以后的技術(shù)文章里詳細(xì)介紹。

二、儀器的功能性和人性化設(shè)計(jì)
     當(dāng)然是越簡單方便的設(shè)計(jì)符合用戶的要求。

熱蓋——現(xiàn)在的PCR儀一般均配備熱蓋,熱蓋溫度設(shè)為105℃,使樣品管頂部的溫度達(dá)到105℃左右,蒸發(fā)的反應(yīng)液就不會產(chǎn)生凝集在管蓋上而改變反應(yīng)體積,這樣用戶就無需再向反應(yīng)管內(nèi)加石蠟油,直接減少后繼反應(yīng)的麻煩。如果是旋轉(zhuǎn)加壓的熱蓋就要特別小心,因?yàn)閴毫Φ竭_(dá)時(shí)沒有明顯的提示,用戶需要根據(jù)經(jīng)驗(yàn)將熱蓋旋到合適位置,不太容易掌握。如果過松,熱蓋沒有充分接觸反應(yīng)管而影響結(jié)果;如果過緊,則會導(dǎo)致反應(yīng)管變形,甚至可能造成熱蓋的機(jī)械故障。新的ESP技術(shù)是指熱蓋加熱時(shí)不接觸樣品管,避免加熱樣品管導(dǎo)致非特異產(chǎn)物,等加熱到設(shè)定溫度后熱蓋下降,將樣品管壓入加熱模塊,下降時(shí)間和壓力都由電子控制。

樣品基座——PCR反應(yīng)多在0.2或者0.5的管子中進(jìn)行,多數(shù)PCR儀也配備了不同的可更換樣品槽適配不同的樣品管。eppendorf有一個有趣的設(shè)計(jì),一個槽內(nèi)帶有0.2和0.5兩種不同樣品孔,不需更換基座就可以分別使用兩種不同的反應(yīng)管,或者96孔板,加原位適配器就可以變成原位PCR了。避免了換基座的麻煩。當(dāng)然不同的反應(yīng)管不可以同時(shí)使用的,因?yàn)楦叨炔煌瑹嵘w不能作用。ABI的9700就可以更換不同的樣品槽,樣品槽系列擴(kuò)增到從0.5到標(biāo)準(zhǔn)96孔,到雙384孔板,分別適合不同的需要,相當(dāng)靈活。

軟件——新的PCR儀都比較注重程序編寫的簡易性。大屏幕,顯示實(shí)時(shí)信息,***,記憶存儲多個程序、自動斷電保護(hù)等都有助于實(shí)驗(yàn)室中的復(fù)雜環(huán)境使用。程序儲存方面,有人覺得儲存程序的多少似乎意義不太大,但是對于實(shí)驗(yàn)人員多、PCR儀每天運(yùn)作頻繁的實(shí)驗(yàn)室來說,每個使用者獨(dú)立儲存自定義的PCR程序,確實(shí)能方便下一次的調(diào)用,會節(jié)約一些時(shí)間。

    綜合考慮,一臺PCR儀選購的關(guān)鍵還是在于用戶自己的要求,有些功能可能都用不上或很少用,用戶需要仔細(xì)斟酌,畢竟是一分錢一分貨。

 

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